近日,生命科学学科顶尖期刊Nucleic Acids Research(IF=16.6)在线发表了我校生命科学与技术学院郑珩课题组的最新研究成果:DRAMP 4.0: an open-access data repository dedicated to the clinical translation of antimicrobial peptides。我校硕士研究生马天玥为论文第一作者,郑珩副教授及劳兴珍副教授为本文的共同通讯作者,中国药科大学为本文的唯一通讯单位。
细菌耐药性是当前全球公共卫生领域面临的重要问题之一。抗菌肽具有广谱抗菌活性,作用机制独特,较难诱导耐药,在耐药细菌感染临床上具有重要应用前景,但受限于稳定性、溶血性以及细胞毒性等性质,目前进入临床研究的抗菌肽仍较少。DRAMP(Data repository of antimicrobial peptides, http://dramp.cpu-bioinfor.org/)第4版更新侧重于抗菌肽的临床转化,首次添加了抗菌肽血清/蛋白酶半衰期稳定性数据,并补充了大量实验测定的抗菌肽溶血/细胞毒性数据。除此以外,本次更新新增了8000多条抗菌肽条目,包括来自中文文献的抗菌肽信息。这些信息和数据可以免费从数据库的download界面下载,可用于促进人工智能辅助的抗菌药物设计。
该工作受到863项目、重大新药专项、国家自然科学基金面上项目和江苏高校优势学科建设工程项目等资助。我校徐寒梅教授对本数据库的立项和建设给予了重大支持和帮助,硕士研究生孙健、范琳琳、康馨月和施国邦等参与前三版数据库的建设和更新工作。
文章链接:https://doi.org/10.1093/nar/gkae1046
(供稿单位:生命科学与技术学院,撰写人:姚嘉仪,审稿人:刘帆)